Diş kökünde oluşan kist veya iltihaplanmanın kök ucunun kesilerek temizlenmesine rezeksiyon denir. Kanal tedavisinin cevap vermeyeceği durumlarda uygulanır. Ayrıca kök ucu rezeksiyonu küçük azı dişi ve ön dişlere uygulanabilir bir yöntemdir. Bu operasyon hekimin tecrübesi ve hastanın uygunluk durumuna göre yaklaşık yarım saat sürer.